臭氣首在風機的抽風作用下進入生物濾池，首先經噴淋水洗段去除顆粒物和調溫調濕，然后經過氣體分布器進入生物濾床。生物濾床中填充了有生物活性的介質（生物填料），如炭質填料等。當臭氧進入床時，臭氣中的污染物從氣相主體擴散到介質外層的水膜而被介質吸收，同時氧氣也由氣相進入水膜，比較終介質表面所附的微生物消耗氧氣而把污染物分解和轉化為二氧化碳、水和無機鹽類，通過排氣口就地排放。微生物所需的營養物質則由介質自身供給。
污水廠采用生物除臭工藝，即生物濾池法。即對各個臭源構筑物產生的臭氣加蓋密封收集后，通過外排風機將集中收集的臭氣吸入生物除臭裝置，臭氣在生物除臭裝置內進行分解、氧化等反應，使臭氣中的氨、硫化氫、甲硫醇和甲烷等惡臭污染物有效分解，處理過的臭氣可達到國家相關排放標準。
生物濾池工藝是微生物除臭，是利用微生物細胞對惡臭物質的吸附、吸收和降解功能，對臭氣進行處理的一種工藝。主要過程如下:產生臭氣的污水處理構筑物通過加蓋設施及收集管道，利用抽風機將臭氣抽送到生物濾池處理系統。
臭氣進入處理系統先經過預洗池進行加濕除塵，然后再進入生物過濾池，臭氣通過濕潤、多孔和充滿活性微生物的濾層，利用微生物細胞對惡臭物質的吸附、吸收和降解功能，微生物的細胞具有個體小、表面積大、吸附性強、代謝類型多樣的特點，將惡臭物質吸附后分解成CO2、H2O、 H2SO4、 HNO3等簡單無機物。有效去除NH3、H2S等惡臭成份，保證設備出氣口達標排放。
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