生物除臭采用塔形式，下層為排氣空間(小阻力排氣)，中間為填料層，上層為氣體收集空間，也為灑水空間。臭氣通過生物除臭塔，其中的臭氣成分被填料捕獲，生長在填料上的微生物作為食物分解，然后成為二氧化碳、水、硫酸、硝酸等穩定的無機物，排入液相。隨著散水的進行，除臭系統被排出。整個系統的需水選用市政自來水，除臭微生物所需要的營養元素除了臭氣成分來自于氣相，其他的微量元素從散水中獲得，其步驟如下：
a．惡臭氣體接觸到受散水而濕潤的生物填料表面的水膜而溶解。
b．溶解于水中的惡臭成分被棲息于生物填料上的微生物吸收分解。
c.吸收的惡臭成分也被微生物吸收、氧化、分解和利用。
其微生物分解惡臭成分的化學反應式為
硫化氫H2S+202→H2SO4；
b.甲硫醇2CH3SH+7O2→2H2SO4+2CO2+2H2O；
c.硫化醇(CH3)2S+5O2→H2SO4+2CO2+2H2O；
d.二甲二硫2(CH3)2S2+13O2→4H2SO4+4CO2+2H2O；
e.氨NH3+2O2→HNO3+H2O；
f.三甲胺2(CH3)3N+13O2→2HNO3+6CO2+8H2O。
從上述反應來看，臭氣成分會分解成二氧化碳、水、硫酸、硝酸等酸性物質。適當的散水可以沖走這些酸性物質，保持適當的微生物生長環境。
“生物除臭”技術的特點：
水的吸收效率高。由于溶解在水中的惡臭成分可以同時被生物填料和生物膜吸附，水相氣味濃度總是很低，類似于化學吸收，相間平衡驅動力大，吸收效率高。
2）生物降解速度快。生物降解速度與臭氣濃度成正比，普通生物除臭主要依靠生物吸附，生物和生物填料共同吸附，生物密度高，降解速率相應加快。
3）惡臭氣體凈化徹底。惡臭成份復雜需要多種微生物參與降解。生物填料與微生物相容性好，有利于各種微生物的生長，能形成豐富的生物群落生物膜，同時有效去除各種臭氣成分。
4）抗負荷波動能力強。惡臭氣體濃度變化較大，負荷波動較大。由于生物填料的吸附性能，可以緩沖調節水相濃度。提高了系統適應負荷波動的能力。
5）穩定運行周期長。
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